Ακόμα και αυτοί που θα υπαχθούν στη ρύθμιση για τα αυθαίρετα δεν θα ησυχάσουν καθώς κενά, ελλείψεις και εκκρεμότητες εξακολουθούν να κάνουν το μέλλον των αυθαιρέτων …αβέβαιο. Για παράδειγμα χιλιάδες πολίτες οι οποίοι έχουν υπαχθεί στη ρύθμιση για τα αυθαίρετα (4014/2011) και έχουν αποπληρώσει το σύνολο του προστίμου βρίσκονται εκτεθειμένοι αν ο νόμος  κριθεί αντισυνταγματικός . Αυτός ο κίνδυνος πιθανόν να εμφανιστεί στην περίπτωση που υλοποιηθεί η απόφαση να διοχετευθεί το 95% των πόρων του Πράσινου Ταμείου στον κρατικό προϋπολογισμό.

Μία άλλη πηγή ανησυχίας είναι ότι αν οι ιδιοκτήτες αυθαιρέτων σε περιοχές εκτός σχεδίου πόλης δεν εκδώσουν οικοδομική άδεια όταν γίνει η ένταξη τότε τα ακίνητα τους θα εξακολουθήσουν να είναι αυθαίρετα. Συγκεκριμένα αν δεν εκδοθεί οικοδομική άδεια, το ακίνητο παραμένει αυθαίρετο το οποίο έχει τακτοποιηθεί για 30 χρόνια. Αν εκδοθεί οικοδομική άδεια, η κατασκευή θα είναι νόμιμη. Ωστόσο το πρόστιμο που έχει καταβληθεί για την τακτοποίηση δεν επιστρέφεται ούτε συμψηφίζεται με υποχρεώσεις εισφοράς σε χρήμα. Συνυπολογίζεται όμως στην έκδοση της οικοδομικής άδειας.

Συνολικά οι γκρίζες ζώνες της ρύθμισης είναι:

* Δεν υπάρχει κανένας έλεγχος των υποβαλλόμενων στοιχείων, με συνέπεια ο καθένας να δηλώνει ό,τι θέλει.

* Εχει προκύψει τεράστιο πρόβλημα με την αδειοδότηση και τη συνέχιση εργασιών σε κτίρια τα οποία έχουν ενταχθεί στη ρύθμιση. Για παράδειγμα, αν ένας πολίτης ζητήσει από την πολεοδομία συνέχιση εργασιών ή προσθήκη ή αλλαγή χρήσης για οικοδομή στην οποία έχει «νομιμοποιήσει» ορισμένα τμήματά της, θα πρέπει να υποβάλει τα σχέδια των τμημάτων αυτών, τα οποία ωστόσο δεν υπάρχουν, καθώς μέχρι στιγμής μόνο «θεωρητικά» υποβάλλονται στο ΤΕΕ. Έτσι όλες οι διαδικασίες έχουν κολλήσει.

* Δεν έχει δοθεί προς χρήση το δελτίο δομικής τρωτότητας, το οποίο είναι υποχρεωτικό από τον νόμο. Δεν έχει ξεκαθαριστεί από το ΥΠΕΚΑ τι θα γίνει με τα κτίσματα τα οποία κρίνονται ακατάλληλα ως προς την αντισεισμικότητά τους. Ποιος θα πάρει την ευθύνη; Τι υποχρεώσεις θα έχουν οι ιδιοκτήτες; Θα πρέπει να κάνουν ενισχύσεις;

* Δεν έχουν δοθεί οι προδιαγραφές για τα σχέδια τα οποία θα πρέπει να υποβληθούν στη δεύτερη φάση. Πού υποβάλλονται; Ποιος τα ελέγχει; Ποιος τα θεωρεί; Πού φυλάσσονται;

Την δυνατότητα πλειστηριασμού ακινήτων λόγω οφειλών προς το δημόσιο θέλει να καταργήσει η κυβέρνηση του Ενρίκο Λέτα, σύμφωνα δημοσίευμα στην εφημερίδα Corriere della Sera. Όπως γράφει η εφημερίδα «ο νέος κανονισμός για την είσπραξη των οφειλών προς το δημόσιο βρίσκεται ήδη σε προχωρημένη φάση επεξεργασίας. Τις περασμένες ημέρες πραγματοποιήθηκε σύσκεψη , στο υπουργείο οικονομικών της Ρώμης για να καθοριστούν σημαντικές λεπτομέρειες». Η κυβέρνηση Λέτα επιθυμεί να ακολουθήσει τις υποδείξεις της επιτροπής οικονομικών υποθέσεων της ιταλικής βουλής: σε ό,τι αφορά τα ακίνητα ιδιωτών ή επιχειρήσεων, σύμφωνα με την Corriere, το κράτος, σε περίπτωση μεγάλων οφειλών, θα μπορεί να προχωρεί σε κατάσχεση, αλλά όχι σε πώληση μέσω πλειστηριασμού για την κάλυψη των ανείσπρακτων οφειλών. Τα ακίνητα αυτά, κατά τις μέχρι τώρα πληροφορίες, θα παραμένουν ιδιοκτησία του ιταλικού δημοσίου μέχρι να καταβάλει ο οφειλέτης το ποσό που χρωστά στο κράτος. Στην συνέχεια, οι πολίτες θα μπορούν να ανακτούν πλήρως τα περιουσιακά στοιχεία τους. Βάσει της σημερινής νομοθεσίας, η κατάσχεση του ακινήτου προβλέπεται για χρέη που ξεπερνούν τις 20.000 ευρώ. Η κυβέρνηση Λέτα όμως προτίθεται να αυξήσει το συγκεκριμένο όριο. Με την κατάργηση των πλειστηριασμών, σύμφωνα με τους σχολιαστές, θα μπορέσουν να περιορισθούν ακραία φαινόμενα, όπως αυτοκτονίες ανέργων και επιχειρηματιών που αδυνατούν τα πληρώσουν τις οφειλές τους. Εξάλλου η κυβέρνηση ετοιμάζεται να αυξήσει τον συνολικό αριθμό των δόσεων που μπορεί να ζητήσει ο κάθε φορολογούμενος για να ρυθμίσει την αποπληρωμή των οφειλών του προς το δημόσιο. Σήμερα, οι ρυθμίσεις αυτές μπορούν να φθάνουν έως και τους 72 μήνες, ενώ στο μέλλον αναμένεται να υπάρξει μεγαλύτερη «ελαστικότητα».